محاسبه شهریه در دانشگاه آزاد اسلامی بر اساس چند متغیر صورت میگیرد. نخستین متغیر، رتبه واحد دانشگاهی است. واحدهای دانشگاه آزاد اسلامی در ۲۶ رتبه تقسیمبندی شدهاند که این رتبهها براساس شاخصهای ساختاری، عملکردی، مالی و اهداف تعیین میشوند. متغیر دوم، مقطع تحصیلی است؛ چراکه شهریه در مقاطع کاردانی،کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری متفاوت محاسبه میشود. همچنین گروههای عمده تحصیلی شامل علوم انسانی، هنر، فنی و مهندسی، پزشکی و پیراپزشکی نیز بر میزان شهریه اثرگذار هستند.